中國農科院：小麥D基因組完整圖譜首繪成功

　　據中國農科院最新消息，該院作物科學研究所研究員賈繼增領銜的研究團隊，在小麥D基因組測序研究中，揭示了轉座子（TE）在小麥基因組中的重要功能，完成了染色體級別的D基因組精細圖譜的繪制，並首次獲得一個完整的整合圖譜。相關研究論文20日在線發表於《自然·植物》期刊上。

　　賈繼增介紹，小麥是世界最重要農作物之一，基因組巨大而且復雜，和其他作物相比轉座子含量特別高。這使得小麥基因組測序組裝異常困難。粗山羊草是小麥D基因組供體種，對小麥品種改良非常重要。該研究團隊在2013年完成了粗山羊草基因組草圖的繪制，研究成果在《自然》上發表，4年多來已被引用412次，成為小麥研究領域高被引論文之一。然而受當時技術條件所限，研究的深入與基因組信息的利用不足。

　　近年來，該團隊利用二代、三代等測序技術與最新的組裝技術，對D基因組重新測序和組裝，將組裝質量提高210倍，完成了染色體級別的D基因組精細圖譜的繪制。利用高質量的組裝結果，准確地進行了基因注釋，構建了基因分布圖、基因表達圖、假基因分布圖、重復序列分布圖、甲基化分布圖、重組率分布圖和smallRNA分布圖。研究發現，粗山羊草基因組中有一批基因在近期發生了復制。

　　研究還重點分析了TE對基因組結構、基因復制、假基因形成與基因表達的影響，發現有近1/2的基因中攜帶有TE，是已測序基因組中攜帶TE基因最多的物種，也是迄今為止報道的假基因數量最多的物種。TE通常還抑制基因的表達。（記者 瞿劍）